Po uruchomieniu systemu, kernel zaczął sypać komunikatami:

[   15.350459] usb 1-1-port2: over-current change #46
[   15.606468] usb 1-1-port2: over-current change #47
[   15.862426] usb 1-1-port2: over-current change #48
[   16.118437] usb 1-1-port2: over-current change #49
[   16.374450] usb 1-1-port2: over-current change #50
[   16.630499] usb 1-1-port2: over-current change #51
[   16.886928] usb 1-1-port2: over-current change #52

Okazało się, że jeden z portów USB przestał działać - został uwalony ale w sumie nie wiem od czego. Jedyne co można zrobić to wyłączyć wadliwy port z systemu:

echo 0 > /sys/bus/usb/devices/1-1\:1.0/1-1-port2/power/pm_qos_no_power_off